تشافي هو من إنتاج مدرسة نادي برشلونة لا ماسيا انضم إلى صفوف برشلونة منذ ان كان في 11 من عمره. سرعان ما شق طريقه من خلال فرق الشباب والاحتياط، وكان لاعباً أساسيا في فريق المدرب جوردي جونزالفو برشلونة اتلتيك الذي فاز بدوري الدرجة الثانية. من خلال تطوره مع فرق الفئات السنية أكسبته الظهور لأول مرة مع الفريق الأول في 18 أغسطس 1998 في نهائي كأس السوبر، الذي سجل فيه هدفاً ضد نادي مايوركا. اول ظهور له في الدوري الاسباني كان ضد فالنسيا في 3 أكتوبر 1998 بفوز برشلونة 3-1. في البداية ظهوره كان بشكل متقطع سواء مع فريق الرديف و الأول, تشافي سجل هدف المباراة الوحيد 1-0 على بلد الوليد عندما كان برشلونة بالمركز 10 في الدوري, مما أدى الى عصر النهضة في النموذج بالنسبة للنادي. بإستمرار مستواه المميز أصبح لاعب أساسياً في فريق لويس فان غال الفائز باللقب. اصابة بيب غوارديولا في الموسم التالي من الدوري الاسباني 1999-00, يعني ذلك أن تشافي أصبح صانع الالعاب الرئيسي لبرشلونة، و احتفظ بهذا المركز منذ ذلك الحين.